技术平台   分支DNA-液相芯片  
       分支DNA－液相芯片技术是定量检测基因mRNA表达水平的最新技术，具有灵敏度高、操作简单、线性范围广、高通量的优势，并适用于多种类型样品（细胞、组织、全血、血斑、石蜡切片等）。该方法不需进行mRNA的提取、不需逆转录、不需PCR、使用多个管家基因作为内参比对基因、同步定量检测超过三十个基因的表达。该方法是目前唯一可检测石蜡包埋组织样本中mRNA表达的技术。以下列表比较了两种技术的优劣。

表. 技术比较
 

液相芯片技术

定量PCR技术

样本

所有样本

新鲜样本

石蜡组织

适用

不适应

mRNA提取

不需要

需要

逆转录

不需要

需要

PCR

不需要

需要

管家基因数

可任意增加

一个

并行检测基因数

超过30个

少于4个

重复性（CV值）

小于15

大于30

操作难度

易

高


      分支DNA－液相芯片技术与传统方法比较拥有明显的优势，它无需进行RNA提取和逆转录，可以用样品裂解液直接检测，也无需对目标片段进行扩增，大幅降低操作过程或多步骤误差积累对结果的影响。特别是在使用福尔马林固定石蜡包埋的方法处理(FFPE)的样品中，RNA的质量受组织处理过程、存放条件、存放时间的影响很大，而RNA的质量对逆转录以及qPCR的效果影响更大。用NaOH处理RNA进行模拟FFPE样品中的降解情况：电泳显示NaOH处理时间越长RNA片段越短；同时用RNA表达检测液相芯片和逆转录-qPCR方法进行检测，结果RNA表达检测液相芯片的检测信号最多下降约40%，而qPCR信号则下降了几百到一千倍。